<b>Modeling the incidence of citrus canker in leaves of the sweet orange variety ‘Pera’

Danielle da Silva Pompeu; Terezinha Aparecida Guedes; Vanderly Janeiro; Aline Maria Orbolato Gonçalves-Zuliane; William Mario de Carvalho Nunes; José Walter Pedroza Carneiro

doi:10.4025/actasciagron.v39i1.28535

Danielle da Silva Pompeu Universidade Estadual de Maringá
Terezinha Aparecida Guedes Universidade Estadual de Maringá
Vanderly Janeiro Universidade Estadual de Maringá
Aline Maria Orbolato Gonçalves-Zuliane Universidade Estadual de Maringá
William Mario de Carvalho Nunes Universidade Estadual de Maringá
José Walter Pedroza Carneiro Universidade Estadual de Maringá

DOI: https://doi.org/10.4025/actasciagron.v39i1.28535

Keywords: zero-inflated Beta distribution, mixture models, inflated Beta regression model, modeling proportions

Abstract

Citrus canker, caused by the bacterium Xanthomonas citri subsp. citri, is one of the most important diseases of citrus. The use of resistant genotypes plays an important role in the management and control of the disease and is the most environmentally sustainable approach to disease control. Citrus canker incidence was recorded in an experiment on nine genotypes of the sweet orange variety ‘Pera’ grafted on four rootstocks. The experiment was started in 2010 and the incidence of citrus canker on the leaves was recorded on a quarterly basis. The incidence data from the experiment were analyzed using a zero-inflated Beta regression model (RBIZ), which is the appropriate method to describe data with large numbers of zeros. Based on the residual analysis, the data fit the model well. The discrete component of the explanatory variable, rootstock, was not significant as a factor affecting the onset of disease, in contrast with the continuous component, genotype, which was significant in explaining the incidence of citrus canker.

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Author Biographies

Danielle da Silva Pompeu, Universidade Estadual de Maringá

Aluna de Pós-Graduação do Programa de Mestrado de Bioestatística na Universidade Estadual de Maringá (UEM), Bacharel em Estatística pela Universidade Federal do Pará (2013).

Terezinha Aparecida Guedes, Universidade Estadual de Maringá

Graduada em Matemática pela Universidade Estadual de Maringá (1981), mestrado em Estatística pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (1985) e doutorado em Engenharia de Produção pela Universidade Federal de Santa Catarina (1996). Atualmente é professor titular da Universidade Estadual de Maringá. Tem experiência na área de Probabilidade e Estatística, com ênfase em Planejamento de Experimentos.

Vanderly Janeiro, Universidade Estadual de Maringá

Possui graduação em Matemática pela Universidade Estadual de Maringá(1995), mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional pela Universidade de São Paulo(2000) e doutorado em Estatística e Experimentação Agronômica pela Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz(2010). Atualmente é Professor assistente da Universidade Estadual de Maringá.

Aline Maria Orbolato Gonçalves-Zuliane, Universidade Estadual de Maringá

Possui graduação em Agronomia (2007) pela Universidade Estadual de Maringá (UEM), Mestrado em Agronomia (2010), pela Universidade Estadual de Maringá, Doutorado em Agronomia (conclusão em 2013). Desenvolveu pesquisa em nível de graduação, como bolsista PIBIC-CNPq/CAPES/Fund.Arauc-UEM ( nos anos de 2005, 2006 e 2007), atuando na área de Fitopatologia - CITROS (Clorose Variegada dos Citros/CVC, Xylella fastidiosa, Cigarrinhas/Hemiptera/Cicadelidae), junto ao Núcleo de Pesquisa em Biotecnologia Aplicada (NBA - UEM). No Mestrado em Agronomia, a área de atuação concentrou-se em Produção Vegetal - Melhoramento Genético Vegetal ( Feijoeiro comum/ Phaseolus vulgaris, Colletotrichum lindemuthianum, caracterização de gene de resistência a doença, Antracnose), junto ao Nucleo de Pesquisa Aplicada a Agricultura (NUPAGRI - UEM). No Doutorado, a área de concentração Proteção de Plantas - Fitopatologia - CITROS (Xanthomonas citri subsp. citri, Epidemiliogia, resistencia de cultivares ao Cancro citrico, Microscopia Eletrônica de Varredura-MEV), atuando junto ao Núcleo de Pesquisa em Biotecnologia Aplicada (NBA - UEM).

William Mario de Carvalho Nunes, Universidade Estadual de Maringá

Professor Associado da Universidade Estadual de Maringá. Possui graduação em Agronomia pela Universidade Estadual de Maringá (1984), mestrado em Fitopatologia - Agronomia - pela ESALQ/USP (1994) e doutorado em Proteção de Plantas-Agronomia pela UNESP (1999). Realizou o Pós-Doutorado junto ao Centro de Citricultura - IAC (2009). Consultor das revistas Tropical Plant Pathology, Summa Phytopathologica, Acta Scientiarum e Citrus Research and Technology. Tem experiência na área de Agronomia, com ênfase em Fitopatologia, atuando principalmente nos temas epidemiologia e biologia molecular das doenças dos citros: cancro cítrico, clorose variegada dos citros, huanglongbing (ex-greening), pinta preta e citrus tristeza virus.

José Walter Pedroza Carneiro, Universidade Estadual de Maringá

Possui graduação em Agronomia pela Universidade Federal de Viçosa (1976) e mestrado em Agronomia Fitotecnia pela Universidade Federal de Viçosa (1980). Curso de Especialização em Produção e Tecnologia de Sementes (ABEAS) com 360 hrs/aula e Gerenciamento de Produção de Sementes (Svalov-Weibull - Suécia) com 360 hrs/aula Atualmente é professor adjunto da Universidade Estadual de Maringá. Tem experiência na área de Agronomia, com ênfase em Fitotecnia, atuando principalmente nos seguintes temas: Sementes de milho, pastagens, Stevia rebaudiana, Pfaffia glomerata e Conyza spp.; substratos orgânicos na produção de mudas