<b>Modeling citrus huanglongbing data using a zero-inflated negative binomial distribution

Eudmar Paiva de Almeida; Vanderly Janeiro; Terezinha Aparecida Guedes; Fabio Mulati; José Walter Pedroza Carneiro; Willian Mario de Carvalho Nunes

doi:10.4025/actasciagron.v38i3.28689

Eudmar Paiva de Almeida Universidade Estadual de Maringá
Vanderly Janeiro Universidade Estadual de Maringá
Terezinha Aparecida Guedes Universidade Estadual de Maringá
Fabio Mulati Universidade Estadual de Maringá
José Walter Pedroza Carneiro Universidade Estadual de Maringá
Willian Mario de Carvalho Nunes Universidade Estadual de Maringá

DOI: https://doi.org/10.4025/actasciagron.v38i3.28689

Keywords: mixed model, random effect, BLUP method, EM algorithm

Abstract

Zero-inflated data from field experiments can be problematic, as these data require the use of specific statistical models during the analysis process. This study utilized the zero-inflated negative binomial (ZINB) model with the log- and logistic-link functions to describe the incidence of plants with Huanglongbing (HLB, caused by Candidatus liberibacter spp.) in commercial citrus orchards in the Northwestern Parana State, Brazil. Each orchard was evaluated at different times. The ZINB model with random effects in both link functions provided the best fit, as the inclusion of these effects accounted for variations between orchards and the numbers of diseased plants. The results of this model show that older plants exhibit a lower probability of acquiring HLB. The application of insecticides on a calendar basis or during new foliage flushes resulted in a three times larger probability of developing HLB compared with applying insecticides only when the vector was detected.

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Author Biographies

Eudmar Paiva de Almeida, Universidade Estadual de Maringá

Graduado em Estatística pela Universidade Federal do Pará (2013), tem experiencia em probabilidade e estatística com enfase em análise de regressão e correlação.

Vanderly Janeiro, Universidade Estadual de Maringá

Possui graduação em Matemática pela Universidade Estadual de Maringá(1995), mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional pela Universidade de São Paulo(2000) e doutorado em Estatística e Experimentação Agronômica pela Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz(2010). Atualmente é Professor assistente da Universidade Estadual de Maringá.

Terezinha Aparecida Guedes, Universidade Estadual de Maringá

Graduada em Matemática pela Universidade Estadual de Maringá (1981), mestrado em Estatística pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (1985) e doutorado em Engenharia de Produção pela Universidade Federal de Santa Catarina (1996). Atualmente é professor titular da Universidade Estadual de Maringá. Tem experiência na área de Probabilidade e Estatística, com ênfase em Planejamento de Experimentos.

Fabio Mulati, Universidade Estadual de Maringá

Possui graduação em Agronomia pela Universidade Estadual de Maringá (2006). Atualmente é Engenheiro Agrônomo da Cooperativa agropecuária e Industrial de Mandaguari(COCARI). Tem experiência na área de Agronomia, com ênfase em Manejo e Tratos Culturais de citros e reflorestamento.

José Walter Pedroza Carneiro, Universidade Estadual de Maringá

Possui graduação em Agronomia pela Universidade Federal de Viçosa (1976) e mestrado em Agronomia Fitotecnia pela Universidade Federal de Viçosa (1980). Curso de Especialização em Produção e Tecnologia de Sementes (ABEAS) com 360 hrs/aula e Gerenciamento de Produção de Sementes (Svalov-Weibull - Suécia) com 360 hrs/aula Atualmente é professor adjunto da Universidade Estadual de Maringá. Tem experiência na área de Agronomia, com ênfase em Fitotecnia, atuando principalmente nos seguintes temas: Sementes de milho, pastagens, Stevia rebaudiana, Pfaffia glomerata e Conyza spp.; substratos orgânicos na produção de mudas.

Willian Mario de Carvalho Nunes, Universidade Estadual de Maringá

Professor Associado da Universidade Estadual de Maringá. Possui graduação em Agronomia pela Universidade Estadual de Maringá (1984), mestrado em Fitopatologia - Agronomia - pela ESALQ/USP (1994) e doutorado em Proteção de Plantas-Agronomia pela UNESP (1999). Realizou o Pós-Doutorado junto ao Centro de Citricultura - IAC (2009). Consultor das revistas Tropical Plant Pathology, Summa Phytopathologica, Acta Scientiarum e Citrus Research and Technology. Tem experiência na área de Agronomia, com ênfase em Fitopatologia, atuando principalmente nos temas epidemiologia e biologia molecular das doenças dos citros: cancro cítrico, clorose variegada dos citros, huanglongbing (ex-greening), pinta preta e citrus tristeza virus.