Análise filogenética de Phytophthora capsici Leonian do Estado de São Paulo baseada na seqüência de nucleotídeos da região ITS-5.8S rDNA - DOI: 10.4025/actascibiolsci.v25i2.2033

Daniel Dias Rosa; Janaina Marianno de Marque; Roseli Chela Fenille; Nilton Luiz de Souza; Eiko Eurya Kuramae

doi:10.4025/actascibiolsci.v25i2.2033

Phylogenetic analysis of Phytophthora capsici Leonian in the state of São Paulo based on the nucleotides sequence of ITS-5.8S rDNA region

Daniel Dias Rosa UNESP
Janaina Marianno de Marque UNESP
Roseli Chela Fenille Laboratorio de Apoio Vegetal - MAPA
Nilton Luiz de Souza UNESP
Eiko Eurya Kuramae Fungal Biodiversity Center

DOI: https://doi.org/10.4025/actascibiolsci.v25i2.2033

Abstract

Phylogenetic analysis through morphological and cultural traits is considered inconsistent and hard to be scientifically accepted once there is no way to establish the direction of evolution on morphological traits. Molecular markers are suitable for phylogenetic analysis. The sequencing of ITS1 and ITS2 (internal transcribed spacers) regions and of 5.8S gene from ribosomal DNA were used to estimate the genetic variation and distance of 10 Phytophthora capsici isolates. The amount of genetic variation amongst isolated P. capsici from distinct regions of São Paulo State was 0.1 to 1.6 and 0.1 to 1.1% at ITS1 and ITS2, respectively, and a phylogenetic distance of about 78.5% between P. capsici and Phytophthora spp. was observed

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Author Biography

Daniel Dias Rosa, UNESP

possui graduação em Engenharia Agronômica pela Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho (2003) , mestrado em Fitopatologia pela Universidade de São Paulo (2006) e ensino médio Escola Tecnica Agropecuaria Estadual Martinho Di Ciero (1997) se formando Tecnico Agropecuario . Tem experiência na área de Fitopatologia, com ênfase em Microbiologia e Biologia molecular, atuando principalmente nos seguintes temas: Diversidade genetica, Fitobactéria, Expressão genica, microarray, meio de cultura, rotas metabolicas, Moleculars plant-signaling, Pathogesis Related Proteins e Marcadores geneticos. Atualmente desenvolve pesquisas, no nivel de Doutorado na UNESP-FCA, relacionadas com patógenos habitantes do solo, visando, principalmente, o agente causal da Hernia das Cruciferas, Plasmodiophora brassicae, com o objetivo de determinar as raças do patógeno no estado de São Paulo, assim como o desenvolvimento de medidas de controle eficientes e melhor entendimento da relação parasitaria deste organismo. Participa ainda de grupo de pesquisa em patógenos de especies arboreas, assim como atua junto a produtores, visando desenvolver o serviço de extensão entre a pesquisa e a prática Currículo Lattes

PDF (Português (Brasil))

Published

2008-04-17

How to Cite

Rosa, D. D., Marque, J. M. de, Fenille, R. C., Souza, N. L. de, & Kuramae, E. E. (2008). Phylogenetic analysis of Phytophthora capsici Leonian in the state of São Paulo based on the nucleotides sequence of ITS-5.8S rDNA region. Acta Scientiarum. Biological Sciences, 25(2), 429-434. https://doi.org/10.4025/actascibiolsci.v25i2.2033

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Issue

Vol 25 No 2 (2003)

Section

Biology Sciences

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