<b>SAMTa - A new proposal for computational analysis of molecular dynamics</b> - 10.4025/actascitechnol.v32i4.2258

Authors

  • Bernardo de Assis Carvalho Bacharelado em Ciência da Computação, Universidade Federal de Lavras, Lavras/MG
  • Teodorico Castro Ramalho Licenciatura em Quí­mica, Universidade Federal de Lavras, Lavras/MG
  • Elaine Fontes Ferreira da Cunha Licenciatura em Quí­mica, Universidade Federal de Lavras, Lavras/MG
  • Daniel Guimarães do Lago Grupo de Quí­mica Computacional, Universidade Federal de Lavras, Lavras/MG

DOI:

https://doi.org/10.4025/actascitechnol.v32i4.2258

Keywords:

SAMTa, molecular dynamics analysis, computational chemistry, mathematical analysis, K-Means algorithm

Abstract

This article provides an overview of the implementation of the System for Molecular Analysis of Trajectories (SAMTa, acronym in Portuguese). It addresses the simulation of molecular compounds using computer approaches, the method of selection by mathematical analysis using K-Means. The results on the development and use of the software are illustrated with a case study concerning EPSP synthase inhibitors.

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Author Biographies

Bernardo de Assis Carvalho, Bacharelado em Ciência da Computação, Universidade Federal de Lavras, Lavras/MG

Graduando em Ciência da Computação pelo Departamento de Ciência da Computação da Universidade Federal de Lavras/MG. Curriculo Lattes: http://lattes.cnpq.br/1451581776565599

Teodorico Castro Ramalho, Licenciatura em Quí­mica, Universidade Federal de Lavras, Lavras/MG

Professor do Departamento de Quí­mica da Universidade Federal de Lavras/MG. Integrante do Grupo de Quí­mica Computacional do Departamento de Quí­mica da Universidade Federal de Lavras/MG. Curriculo Lattes: http://lattes.cnpq.br/2778224426297839

Elaine Fontes Ferreira da Cunha, Licenciatura em Quí­mica, Universidade Federal de Lavras, Lavras/MG

Professora do Departamento de Quí­mica da Universidade Federal de Lavras/MG. Integrante do Grupo de Quí­mica Computacional do Departamento de Quí­mica da Universidade Federal de Lavras/MG. Curriculo Lattes: http://lattes.cnpq.br/7732799130158538

Daniel Guimarães do Lago, Grupo de Quí­mica Computacional, Universidade Federal de Lavras, Lavras/MG

Graduado em Ciência da Computação pelo Departamento de Ciência da Computação da Universidade Federal de Lavras/MG. Currí­culo Lattes: http://lattes.cnpq.br/6816990418217921

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Published

2010-12-02

How to Cite

Carvalho, B. de A., Ramalho, T. C., Cunha, E. F. F. da, & Lago, D. G. do. (2010). <b>SAMTa - A new proposal for computational analysis of molecular dynamics</b> - 10.4025/actascitechnol.v32i4.2258. Acta Scientiarum. Technology, 32(4), 355–360. https://doi.org/10.4025/actascitechnol.v32i4.2258

Issue

Vol. 32 No. 4 (2010)

Section

Computer Science

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