<b>Development and characterization of microsatellite markers for <i>Tibouchina hatschbachii</i> (Melastomataceae), an endemic and habitat-restricted shrub from Brazil

  • Fabiano Rodrigo Maia Universidade Estadual de Campinas
  • Patricia Sanae Sujii Universidade Estadual de Campinas
  • Renato Goldenberg Universidade Federal do Paraná
  • Viviane Silva Pereira Universidade Federal do Paraná
  • Maria Imaculada Zucchi Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios

Resumo

Tibouchina hatschbachii Wurdack (Melastomataceae) is an autogamous shrub restricted to granite (GO) and sandstone (SO) rock outcrops from subtropical Brazil. We designed primers for the amplification of microsatellite regions for T. hatschbachii, and characterized these primers to estimate genetic diversity parameters and contemporary genetic structure patterns. Eight loci were successfully amplified and were characterized using 70 individuals from three natural populations. Polymorphic information content ranged from 0.200 to 0.772 per locus. All loci were polymorphic, with allele numbers ranging from two to eight. The low degree of polymorphism may be explained by the fact that T. hatschbachii has disjunct populations and a recent genetic bottleneck, and also that it is self-pollinated. The observed and expected heterozygosities ranged from 0.115 to 1.000 and from 0.112 to 0.800, respectively. We observed private alleles in all loci. These are important features that enable us to identify population differentiation and help to us understand gene flow patterns for T. hatschbachii in subtropical Brazil. Eight microsatellite loci from other species of Tibouchina amplified positively in T. hatschbachii.

 

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Biografia do Autor

Fabiano Rodrigo Maia, Universidade Estadual de Campinas
Doutorando do Programa de Pós-Graduação em Biologia Vegetal da Universidade Estadual de Campinas. Desenvolve suas atividades no Instituto de Biologia Vegetal da UNICAMP e no Departamento de Botânica da UFPR. Atualmente atua na área de biologia reprodutiva e da polinização de espécis de Melastomataceae, e também na área de genética de populações destas plantas. Desenvolve seus estudos utilizando marcadores microssatélites plastidiais e nucleares.
Publicado
2016-12-08
Como Citar
Maia, F. R., Sujii, P. S., Goldenberg, R., Pereira, V. S., & Zucchi, M. I. (2016). <b>Development and characterization of microsatellite markers for <i>Tibouchina hatschbachii</i&gt; (Melastomataceae), an endemic and habitat-restricted shrub from Brazil. Acta Scientiarum. Biological Sciences, 38(3), 327-332. https://doi.org/10.4025/actascibiolsci.v38i3.31496
Seção
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